Havsnejonögats nedgång de sista 10 åren är oroväckande. Antalet nejonögon som leker i åarna på Västkusten 2019 är troligen mindre än 50 st. År 2007 räknades beståndet till mellan 500 -1000    individer.  Vattenkraftdammar som hindrar fiskens vandringar och ödelägger lekområden samt utfiskningen av havet är de stora orsakerna till minskningen.